Будущий священномученик Иоанн родился в селе Сутка 4 августа 1884 г. в семье священника. Был псаломщиком в селе Веретея Мологского уезда, в 1917 г ему была предоставлена диаконская вакансия при церкви родного с. Сутки Мологского уезда, с 1924 г. служил священником в селе Княжич-Городок Мологского уезда (ныне затоплен Рыбинским водохранилищем). С 1924 по 1934 г. был настоятелем Знаменского храма в селе Михайловском что на реке Черемхе. С 22 апреля 1937 года зарегистрирован священником в селе Колегаево в храме св. Иоанна Предтечи. Он переехал сюда вместе с супругой, Лидией Изотовной и младшим сыном Александром, 15 лет, (еще у отца Иоанна с матушкой была старшая замужняя дочь. Сколько всего у них было детей – пока точно неизвестно).
В это время в Колегаево была зарегистрирована обновленческая община. Начиная с революции до 1942 г. (более поздних документов по храму пока не нашли), по найденным архивным источникам, из 19 священников служивших в Колегаевском храме, лишь треть относилась к
«староцерковным сергиевцам». Община эта жила активной церковной жизнью, сохранились документы о запросах в Некоузский РИК, к которому относилось село, о разрешении хождения с иконами на Пасху или со святой водой в Крещенскую неделю. В случае отказа поступить по прошению, члены двадцатки грозились написать письма в вышестоящие инстанции с требованиями разобраться в ситуации. В некоторых запросах, община называла себе не обновленческой: лишь бы прислали священника.
Каким-то чудом попал в это место и православный священник Иоанн Смирнов. Однако недолго прослужил будущий новомученик в храме. Уже в октябре 1937 г. (23 числа) он был арестован. У него конфисковали паспорт, и требный набор: епитрахиль, поручи, и дароносица, несколько церковных книг, фотографию и наперсный крест. На этот момент ему было 53 года. Через несколько дней после ареста состоялись допросы свидетелей – руководящих членов общины – председателя двадцатки, председателя церковного совета, старосты и благочинного округа. Все они дружно показали на отца Иоанна, что он против колхозов, не согласен со Сталинской конституцией, высказывает пораженческие взгляды на Советскую власть.
На первом допросе отцу Иоанну были заданы вопросы о его знакомых и связях. Однако через несколько дней состоялся повторный допрос, на котором ему были зачитаны показания свидетелей и предъявлено обвинение в ведении антисоветской и контрреволюционной деятельности. Будущий новомученик признал, что призывал верующих к сплочению вокруг Церкви, просил помощи в уплате налогов, и говорил, что Советская власть нажимает на Церковь, пытаясь задушить её налогами. Но протестовал против обвинения его в контрреволюционной деятельности, а на зачитанные показания свидетелей объявил, что это ложь. Через несколько дней батюшку допрашивали заново. Что он пережил за этот промежуток времени – нам сложно представить, можно лишь предполагать… На этом, последнем допросе, состоявшемся 31 октября, отец Иоанн слово в слово подтвердил часть показаний обвинителей, но все же отказывался признавать за собой антисоветскую агитацию и пораженческую пропаганду. 2 ноября тройка УНКВД Ярославской области вынесла приговор: расстрел. 6 ноября приговор был приведен в исполнение.
В 2000 году отец Иоанн Смирнов был причислен к лику святых новомучеников и исповедников Российских Архиерейским юбилейным Собором РПЦ.
Подвиг священномученика Иоанна сродни подвигам древних мучеников: его праведная кончина – это плод и результат всей предыдущей жизни. Молитвами его да даст нам Господь крепость духа и верность Христу и Церкви. Священномучениче Иоанне, моли Бога о нас!
